Skibotn Observatorium ligger like ved Skibotn Feltstasjon. Stedet ble etablert som astronomisk observatorium og nordlysobservatorium på slutten av 70-tallet. Observatoriet ligger 2 km fra EISCAT_3D.
Ved observatoriet utføres i dag primært optiske og passive radio-målinger av den øvre atmosfæren og ionosfæren i regi av Tromsø Geofysiske Observatorium. Det astronomiske teleskopet disponeres av Tromsø Astronomiforening. Stedet brukes også i økende grad til gjesteinstrumentering, noe som forventes å øke i årene som kommer når EISCAT_3D blir operativ.
For øyeblikket er det i overkant av 20 instrumenter som gjør målinger og følgende institusjoner er representert:
- National Institute of Polar Research (NIPR), Japan
- University of Southampton
- University of Electro Communications, Tokyo
- Nagoya University
- Universitetet i Oslo
- Belgian Institute of Space Aeronomy
- Institute for Planetary sciences and Astrophysics, Grenoble (IPAG)
Sideansvarlig: Johnsen, Magnar Gullikstad