Stillingsbeskrivelse

Jeg er medlem av forskningsgruppene MikroPop ved Institutt for farmasi og LacZymes som er en del av Forskningsgruppe for Vert-mikrobe interaksjoner (HMI) ved Institutt for medisinsk biologi. Forskningen min er sentrert rundt bakteriell evolusjon og tilpasning, med særlig fokus på hvordan patogene bakterier utvikler seg under infeksjoner og som respons på miljømessige seleksjonstrykk. Ved å kombinere eksperimentell evolusjon, molekylærbiologi og eksperimentell mikrobiologi, ønsker jeg å bidra til en bedre forståelse av bakteriell evolusjon i kliniske og økologiske kontekster.

Biofilmtilpasning: Et sentralt tema i forskningen min er hvordan bakterier veksler mellom planktonisk vekst og biofilmlivsstil, og hvordan seleksjonstrykk i strukturerte miljøer former denne overgangen. Ved hjelp av eksperimentell evolusjon kombinert med helgenomsekvensering studerer jeg hvordan mutasjoner i regulatoriske nettverk (f.eks. c-di-GMP-signalsystemet) letter bakteriell tilpasning, og hvordan ombygging av regulatoriske systemer ligger til grunn for adaptasjon. I tillegg er jeg interessert i hvordan biofilmlivsstilen former evolusjonen av bakterier, men også små genetiske enheter som mobile genetiske elementer og antibiotikaresistensgener.

Evolusjon under infeksjon: Et annet hovedfokus er bakteriell evolusjon under systemiske infeksjoner. Ved bruk av serielle kliniske isolater innsamlet gjennom infeksjonsforløpet, ønsker jeg å rekonstruere evolusjonære trajektorier og identifisere adaptive mutasjoner med funksjonelle konsekvenser for fitness i vertsorganismen. Dette arbeidet integrerer helgenomsekvensering, funksjonell genetikk og fenotypisk analyse for å forstå de molekylære mekanismene som driver tilpasning i verten.

Infeksiøs endokarditt: Jeg er tilknyttet infeksjonsmedisinsk avdeling ved Universitetssykehuset Nord-Norge (UNN) og Nordnorsk kvalitetsregister for endokarditt, som har som mål å øke kunnskapen om pasienter som diagnostiseres med og behandles for endokarditt i Nord-Norge. Infeksiøs endokarditt representerer også et særlig egnet modellsystem for å studere evolusjon i verten og samspillet mellom vert og patogen under intenst seleksjonstrykk. Mine forskningsinteresser innen IE spenner over klinisk epidemiologi, mikrobiell genomikk og eksperimentelle infeksjonsmodeller, med mål om å identifisere mikrobielle og vertsspesifikke faktorer som påvirker kliniske utfall.

Pågående prosjekter:

- Evolusjon av Vibrio cholerae biofilmer.
- Bidireksjonell evolusjon av Klebsiella pneumoniae i human urin.
- Bakteriell tilpasning under infeksiøs endokarditt.