Bilde av Wally, Youssef
Bilde av Wally, Youssef
Stipendiat Institutt for fysikk og teknologi youssef.m.wally@uit.no +4740630581 Tromsø Her finner du meg

Youssef Wally


Stillingsbeskrivelse

Jeg fokuserer på avanserte representasjonslæringsteknikker, med særlig vekt på å utvikle nye likhetsmål og klyngemetoder. Forskningen min utforsker hvordan relasjons—utvunnet fra komplekse datasett som romlig omikk—kan fange opp intrikate avhengigheter utover parvise interaksjoner, og dermed gi en dypere forståelse av medisinske og biologiske data. Gitt utfordringene knyttet til varierende strukturer og merkede samples, har arbeidet mitt som mål å integrere underliggende semantiske relasjoner gjennom kunnskaps-embeddinger og ikke-euklidiske geometrier. Ved å utnytte disse avanserte teknikkene søker jeg å utvikle mer meningsfulle likhetsmål som forbedrer analysen av medisinske og helserelaterte data, og som til syvende og sist bidrar til bedre prediktiv modellering og beslutningstaking i kliniske og biomedisinske anvendelser.


  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Flatland and Beyond: Mutual Information Across Geometries
    IEEE International Conference on Computer Vision Workshop (ICCVW) 19. oktober 2025 DOI / ARKIV
  • Lara Elvevåg, Youssef Wally, Benjamin Ricaud, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Charting Cellular Networks in the Tumor Microenvironment: Graph Visualizations in Highly-Multiplexed Breast Cancer Tissue
    05. januar 2026 DOI / ARKIV
  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Hyperbolic Representation Learning for Spatial Biology: Evaluating Cell Type Hierarchies in Breast Cancer Imaging Data
    05. januar 2026 DOI / ARKIV
  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Hyperbolic Representation Learning for Spatial Omics
    15. november 2025 ARKIV
  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Mutual Information Across Geometries
    25. november 2025 ARKIV
  • Youssef Wally, Martin Giese, Basil Ell, Benjamin Ricaud, Elisabeth Wetzer :
    Cell Niche Discovery via Association Rules Mining
    25. november 2025 ARKIV
  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Hyperbolic Representation Learning for Spatial Biology: Capturing Cell Type Hierarchies in Breast Cancer
    07. desember 2025 DOI / ARKIV
  • Youssef Wally, Jingsong Liu, Elisabeth Wetzer, Peter Schüffler :
    CLEAR-WSI: Foundation Model Empowered Whole Slide Image Retrieval
    29. oktober 2025 ARKIV
  • Elisabeth Wetzer, Youssef Wally, Artem Galushko, Elisavet Kozyri, Kristoffer Wickstrøm :
    How to Tackle Bias and Protect Privacy in the Age of AI?
    17. september 2025 DOI / ARKIV
  • Youssef Wally, Jinsong Liu, Elisabeth Wetzer, Peter Schüffler :
    Computational Pathology Seminar at The Arctic University of Norway - UiT
    02. oktober 2025 ARKIV
  • Youssef Wally, Johan Mylius-Kroken, Michael Kampffmeyer, Rezvan Ehsani, Vladan Milosevic, Elisabeth Wetzer :
    Presentation at PhD school on multi-modal learning
    11. august 2025 ARKIV

  • De 50 siste resultatene vises på siden. Se alle arbeider i NVA her →

    Publikasjoner utenom Cristin

    • DiaMond: Dementia Diagnosis with Multi-Modal Vision Transformers Using MRI and PET
    • Personalized k-fold Cross-Validation Analysis with Transfer from Phasic to Tonic Pain Recognition on X-ITE Pain Database


    Forskningsinteresser

    Mine interesser ligger i skjæringspunktet mellom medisinske og helserelaterte data, med et sterkt fokus på å utvikle avanserte likhetsmål for data. Spesielt er jeg opptatt av å utnytte representasjonslæringsteknikker og ikke-euklidiske embedding-metoder for å forbedre analysen av pasientjournaler, biologiske nettverk og kliniske beslutningssystemer. Ved å integrere domeneekspertise—slik som de hierarkiske relasjonene mellom medisinske diagnoser, de funksjonelle forbindelsene i molekylære interaksjoner eller den kontekstuelle betydningen av kliniske forløp—har jeg som mål å skape mer meningsfulle likhetsmål som styrker prediktiv modellering og kunnskapsutvinning i helsesektoren. I tillegg utforsker jeg hvordan relasjonelle taksonomier av medisinske konsepter og pasientforløp kan embeddes på en effektiv måte for å forbedre strategier for datautvidelse, og dermed øke robustheten og tolkbarheten til maskinlæringsmodeller i medisinske anvendelser.

    Undervisning

    • FYS-2010 Image Processing
    • FYS-2021 Machine Learning

    Medlem i forskningsgruppe



    Forskningsparken 1 B201


    Klikk for større kart



    Vedlegg: