Bioinformatikk som valgfag i informatikkprogrammene

Det er under planlegging en valgfagspakke rettet mot bioinformatikk, som kan anvendes fra 3. til 9. semester på informatikkprogrammene.

Jensen, Svein Tore
Publisert: 19.11.10 00:00 Oppdatert: 19.11.10 13:50

Det kan på studieprogrammene i informatikk velges relativt fritt mellom valgfag ved UiT. IFI har påbegynt arbeid med mulige ”valgfagspakker” der en anbefalt rekkefølge og kombinasjon av emner fra andre fag kan følges. Dette vil være utvalgte emner basert på dialog mellom IFI og det aktuelle fagmiljø, slik at nødvendig faglig grunnlag og helhetlig sammenheng blir ivaretatt. Tanken bak dette er en bedre synliggjøring av hvordan informatikk på en relevant og attraktiv måte kan kombineres med andre fag.

5-ÅRIG INTEGRERT MASTERSTUDIUM I INFORMATIKK / SIVILINGENIØRSTUDIET

I studieplan for sivilingeniørstudiet er 70 studiepoeng valgfag. Av disse må 10 av dem være i kategorien ikke-realfaglige valgfag. I 9. semester så er det lagt opp til spesialisering i informatikk, men tematisk så kan denne ligge mot bioinformatikk. Det kan også diplomoppgaven i siste semester.

Semester

10 studiepoeng

10 studiepoeng

10 studiepoeng

1. sem (høst)

INF-1100 Innføring i programmering

MAT-1001 Kalkulus 1

eller

MAT-0001 Brukerkurs i matematikk

MAT-1005 Diskret matematikk 1

2. sem (vår)

INF-1101 Datastrukturer og algoritmer

INF-1400 Objektorientert programmering

STA-1001 Statistikk og sannsynlighet 1

eller

STA-0001 Brukerkurs i statistikk 1

3. sem (høst)

INF-2200 Datamaskinarkitektur og -organisering

INF-2101 Algoritmer

STA-3300 Applied Statistics 2

eller

KJE-1001 Introduksjon til kjemi og kjemisk biologi

4. sem (vår)

INF-2201 Operativsystem

FIL-0700 Examen philosophicum, Tromsøvarianten

5. semester (høst)

INF-2301 Computer communication and security

INF-2700 Databases

KJE-1001 Introduksjon til kjemi og kjemisk biologi
eller

KJE-2002: Molecular Structural Chemistry

6. sem (vår)

INF-2900 Software engineering

Ikke-realfaglig valgfag

Valgfag

7. sem (høst)

INF-3200 Distributed Systems Fundamentals

INF-3201 Concurrent and Parallel Programming

KJE-2004 Introduksjon til Bioinformatikk

8. sem (vår)

INF-3203 Advanced Distributed Systems

INF-3701 Advanced database systems

KJE-XXXX Avansert Bioinformatikk

9. sem (høst)

Spesialisering i informatikk (prosjekt oppgave)

INF/KJE-YYYY Seminar om Bioinformatikk Systemer

10. sem (vår)

INF-3981 Master's Thesis in Computer Science

Tverfaglig forsking mot bioinformatikk

Valgfagene er valgt for å gi studenter som er interessert i tverrfaglig forskning en bred bakgrunn som gir en spesialisering mot bioinformatikk og kjemi-informatikk, og muligheter for diplom oppgave med disse som applikasjonsdomene.

Bioinformatikk er anvendelsen statistikk og informatikk for å forstå molekylær biologi. Tilsvarende er kjemi-informatikk anvendelse av statistikk og informatikk for strukturell kjemi. Begge disse har til felles at de krever lagring, prosessering, analyse, og visualisering av veldig store og komplekse datasett. For eksempel kan en diplomoppgave bestå i å designe, implementere, og evaluere ett system for lagring av disse store datasettene.

Valgfagene i tabellen ovenfor vil gi studentene den nødvendige bakgrunnen for å forstå problemene, metodene, og forskningen innenfor bioinformatikk og kjemi-informatikk. Det avanserte statistikk kurset (STA-3300) vil gi nødvendig bakgrunn for å forstå de statistikkmodellene som er brukt for å analysere data innen bioinformatikk og kjemi-informatikk. Kjemikursene vil gi en introduksjon og forståelse for molekylærstrukturene som modelleres og analyseres. Dessverre er det ikke mulig å kombinere alle disse tre fagene siden alle går i høstsemesteret.

Bolken med introduksjon til bioinformatikk (KJE-2004), avansert bioinformatikk (kurskode ikke klart), og seminar om bioinformatikk (kurskode ikke klart) vil gi en spesialisering som lar studentene ta en prosjektoppgave og senere diplomoppgave med bioinformatikk som applikasjonsdomene. Disse fagene vil være tverrfaglig og samarbeid med biologer vil inngå i kursene. I prosjekt oppgaven og diplomoppgaven vil studentene jobbe med informatikk forskning, men i en tverrfaglig forskningsgruppe hvor de jobber sammen med biologer, kjemikere, og genetikere. Det vil forventes at arbeidet til studentene vil kunne bli tatt i bruk av samarbeidspartnerne samtidig som det løser interessante problemer innenfor informatikk.

3-ÅRIG BACHELORSTUDIUM I INFORMATIKK

I studieplan for bachelorstudiet i informatikk er det 40 studiepoeng valgfag. Studentene kan velge valgfag fritt fra UiTs emneportefølje så fremt emnene ikke er adgangsregulerte.

Semester

10 studiepoeng

10 studiepoeng

10 studiepoeng

1. sem (høst)

INF-1100 Innføring i programmering

MAT-0001 Brukerkurs i matematikk

eller

MAT-1001 Kalkulus 1

MAT-1005 Diskret matematikk 1

2. sem (vår)

INF-1101 Datastrukturer og algoritmer

INF-1400 Objektorientert programmering

STA-0001 Brukerkurs i statistikk 1

eller

STA-1001 Statistikk og sannsynlighet 1

3. sem (høst)

INF-2200 Datamaskinarkitektur og -organisering

INF-2101 Algoritmer

STA-3300 Applied Statistics 2
eller

KJE-1001 Introduksjon til kjemi og kjemisk biologi

4. sem (vår)

INF-2201 Operativsystem

FIL-0700 Examen philosophicum, Tromsøvarianten

5. sem (høst)

KJE-1001 Introduksjon til kjemi og kjemisk biologi
eller

KJE-2002: Molecular Structural Chemistry

INF-2700 Databases

INF-2301 Computer communication and security

6. sem (vår)

INF-2900 Software engineering

Valgfag

INF-3701 Advanced database systems

Se ovenfor for en beskrivelse av valgfagene.

2-ÅRIG MASTERSTUDIUM I INFORMATIKK

I studieplan for masterstudiet er det åpnet opp for 2 valgfagsemner, som kan være innen bioinformatikk. Dette forutsetter at studenten har dekket nødvendige forkunnskaper i kjemi som en del av bachelorstudiet.


Term

10 ects

10 ects

10 ects

First term (autumn)

INF-3200 Distributed Systems Fundamentals

INF-3201 Concurrent and Parallel Programming

KJE-2004 Introduksjon til bioinformatikk

Second term (spring)

INF-3203 Advanced Distributed Systems

INF-3990 Master's Thesis in Computer Science

KJE-XXX Avansert Bioinformatikk

Third term (autumn)

INF-3990 Master's Thesis in Computer Science

INF/KJE YYYY Seminar om Bioinformatikk Systemer

Fourth term (spring)

INF-3990 Master's Thesis in Computer Science

Se ovenfor for en beskrivelse av valgfagene.

Jensen, Svein Tore
Publisert: 19.11.10 00:00 Oppdatert: 19.11.10 13:50
Vi anbefaler