Masarykova univerzita v Brno er oppkalt etter T. G. Masaryk, en tsjekkisk akadmiker og filosof, best kjent som grunnleggeren av Tsjekkoslovakia og landets første president. Han sørget for keiserlig godkjenning fra Wien til å opprette et universitet i Brno i 1919. Universitetet ble stengt under Nazi-okkupasjonen i 6 å, og mange akademikere ble drept. Under kommunistregimet ble det juridiske fakultet og farmasi-fakultetet-det eneste i landet- stengt, og universitetets navn blir byttet til Jan Evangelista Purkyne, en tsjekkisk biolog. Etter fløyels-revolusjonen i 1989 får det igjen navnet Masaryk. I 2018 er universitetet det nest største i landet med over 35000 studenter og 5200 ansatte fordelt på 10 fakulteter.