BIO-2608 Metoder i molekylær bioteknologi - 10 stp

Emnet gir innsikt og trening i utvalgte eksperimentelle teknikker med relevans både for framtidig mastergradsarbeid og aktuelle arbeidsområder innen laboratorierettet biologi. Det gjennomføres et eksperimentelt prosjekt som omfatter kloning og uttrykk i bakterie av genet for et antimikrobielt peptid opprinnelig isolert fra et marint invertebrat dyr. Genet blir sekvensert ved bruk av sanger-sekvensering. Påvisning av rekombinant produkt blir gjort ved western blot og deretter blir peptidet renset opp og testet for bioaktivitet ved bruk av bioassays.

Obligatoriske forkunnskapskrav: Se oversikt nedenfor. Tilsvarende emner godkjennes også.

Sikkerhetsopplæring: Laboratorieundervisningen blir gjennomført under veiledning, der egnet verneutstyr/tiltak (hansker, frakk, jobb i avtrekkskap) blir påkrevd.

Generell studiekompetanse eller realkompetanse + Matematikk R1 eller (S1+S2) og enten

• Matematikk (R1+R2) eller
• Fysikk (1+2) eller
• Kjemi (1+2) eller
• Biologi (1+2) eller
• Informasjonsteknologi (1+2) eller
• Geologi (1+2) eller
• Teknologi og forskningslære (1+2).

Søknadskode 9197 enkeltemner i realfag.

I løpet av kurset vil du få

Kunnskap om:

• Bioinformatiske verktøy
  • BLAST
  • Alignment
  • Annotering
• Rekombinant DNA teknikker
  • PCR
  • Kloning
  • Transformering
• Uttrykking- og opprensingssystemer for peptider
  • T7 RNA polymerase/promoter uttrykkingssystem
  • His-Tag opprensning av peptider
• Bioaktivitetstesting
  • MIC-testing
  • Toksisitetstest

Ferdigheter:

• Klone gener ved bruk av vektor og PCR
• Transformere og uttrykke peptider og proteiner i Escherichia coli celler
• Verifisere uttrykking av peptider og proteiner med SDS-gel og western blotting
• Opprensing av peptid/proteiner ved bruk av His-tag
• Antibakteriell og toksisitetstesting av peptid

Generell kompetanse:

• Innsikt i generelle metoder i molekylær bioteknologi
• Kjenne til antimikrobielle peptider
• Innsikt i hvordan planlegge og utføre laboratorieoppgaver alene og i grupper <- det blir jo lite arbeid alene, mest i par.
• Vurdere og presentere resultatene i en labrapport