Foto: Kaja Alexandra Halvei-Larsen
Jakob Peder Pettersen
Stillingsbeskrivelse
Jakob Peder Pettersen er postdoktor ved Centre for New Antibacterial Strategies (CANS) og del av Health Data Lab ved Institutt for Informatikk (IFI). Hans fagområde er systembiologi der han arbeider med storskala analyse av biologiske datasett og utvikling av modelleringsverktøy.
Vitenskapelige arbeidsområder
Jakob Peder Pettersen,
Sandra Castillo,
Paula Jouhten,
Eivind Almaas
:
Genome-scale metabolic models reveal determinants of phenotypic differences in non-Saccharomyces yeasts
Jakob Peder Pettersen,
Eivind Almaas
:
Parameter inference for enzyme and temperature constrained genome-scale models
Jakob Peder Pettersen,
Eivind Almaas
:
csdR, an R package for differential co-expression analysis
Jakob Peder Pettersen,
Madeleine S. Gundersen,
Eivind Almaas
:
Robust bacterial co-occurence community structures are independent of r- and K-selection history
Jakob Peder Pettersen,
Einar Holsbø
:
Efficient and reproducible bioinformatic pipelines for single cell bacterial transcriptomics
2025
Jakob Peder Pettersen,
Eivind Almaas
:
What Are Enzyme and Temperature Dependent Genome-Scale Models (etcGEMs) and How Do They Behave?
2022
Jakob Peder Pettersen,
Olav Vadstein,
Eivind Almaas
:
What do co-occurence network actually tell us? A case study.
2020
De 50 siste resultatene fra Cristin vises på siden. Se alle arbeider i Cristin her →
Forskningsinteresser
- Bioinformatiske arbeidsflyter for prokaryot scRNA-seq
- Genomskala metabolsk modellering. Dette omfatter Flux Balanse Analysis (FBA) med utvidelser (etcFBA, dFBA)
- Mikrobiell økologi
- Inferens av korrelasjonsnettverk
- Integrering av måleenheter i differensiallikningsløsere uten ytelsesreduksjon
CV
Se min profil på LinkedIn.