Prosjekter ved bioimaging - IMB
Bioimaging-plattformen skal være en ressurs for brukerne. Her er noen eksempler på forskningsprosjekter der plattformen er en viktig bidragsyter.
Ved molekylær kreftforskningsgruppe studeres autofagi, cellesignallering og regulering av transkripsjon i forbindelse med kreft. I samarbeid med Bioimaging-plattformen er det utviklet et cellesystem for autofagi-målinger ved blant annet flowcytometri og konfokalmikroskopi. Proteinet p62/SQSTM1 brytes ned ved autofagi og fungerer i fusjon med GFP som et "autofagometer" til bruk i blant annet screening-forsøk (se figur).
Prosjekt 2 - Tor Stuge (flow/sortering)
Prosjekt 3 - Christine Rinaldo (mikroskopi)
Prosjekt 4 - Steingrim/Plantebiologi (mikroskopi)
Prosjekt 5 - Lytix (levende celler-mikroskopi)
Prosjekt 6 - Biofilm
Dersom du publiserer eller presenterer data som er produsert ved plattformen ber vi om at dette nevnes på relevant sted. Bruk f.eks. følgende tekst:
Confocal microscopy was performed at the University of Tromsø Bioimaging Core Facility.
Vi ber óg om å bli informert ved publisering slik at listen nedenfor kan holdes oppdatert.
Publikasjoner der bioimaging-plattformen har vært involvert:
| Larsen KB et al. A reporter cell system to monitor autophagy based on p62/SQSTM1. Autophagy. 2010 28(6):[Epub ahead of print] |
| Lauksund et al. Atlantic salmon IPS-1 mediates induction of IFNa1 and activation of NF-κB and localizes to mitochondria. Dev Comp Immunol. 2009 33(11):1196-204. |
| Kirkin et al. A role for NBR1 in autophagosomal degradation of ubiquitinated substrates. Mol Cell. 2009 33(4):505-16. |
| Bjørkøy et al. Monitoring autophagic degradation of p62/SQSTM1. Methods Enzymol. 2009 452:181-97. |
| Flemming et al. High in vitro antimicrobial activity of synthetic antimicrobial peptidomimetics against staphylococcal biofilms. J Antimicrob Chemother. 2009 63(1):136-45. |
| Fredheim et al. Biofilm formation by Staphylococcus haemolyticus. J Clin Microbiol. 2009 47(4):1172-80. |
| Gosert et al. Polyomavirus BK with rearranged noncoding control region emerge in vivo in renal transplant patients and increase viral replication and cytopathology. J Exp Med. 2008 205(4):841-52. |
| Pankiv et al. p62/SQSTM1 binds directly to Atg8/LC3 to facilitate degradation of ubiquitinated protein aggregates by autophagy. J Biol Chem. 2007 282(33):24131-45. |
| Sjøttem et al. The ePHD protein SPBP interacts with TopBP1 and together they co-operate to stimulate Ets1-mediated transcription. Nucleic Acids Res. 2007 35(19):6648-62. |
| Bruun et al. The third helix of the homeodomain of paired class homeodomain proteins acts as a recognition helix both for DNA and protein interactions. Nucleic Acids Res. 2005 33(8):2661-75. |
| Bjørkøy et al. p62/SQSTM1 forms protein aggregates degraded by autophagy and has a protective effect on huntingtin-induced cell death. J Cell Biol. 2005 171(4):603-14. |
| Lamark et al. Interaction codes within the family of mammalian Phox and Bem1p domain-containing proteins. J Biol Chem. 2003 278(36):34568-81. |
Kontaktinformasjon
Eva Sjøttem
Leder
L9.251
Tlf 77 64 64 25
Kenneth Bowitz Larsen
Konfokalmikroskopi
L8.143
Tlf 77 64 53 20
Roy André Lyså
Flowcytometri/cellesortering
L8.143
Tlf 77 64 69 88
